Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 LYPLA2-203ENST00000374503 868 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 CPSF4L-202ENST00000397671 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 SAA1-202ENST00000405158 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 PYM1-203ENST00000408946 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 AC011676.2-201ENST00000518520 584 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 ABCC6P1-203ENST00000565566 1170 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 AC006986.1-201ENST00000612764 241 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 AC005609.5-201ENST00000624712 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 TTN-AS1-264ENST00000627564 1319 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 RN7SL523P-201ENST00000484401 298 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 AC020922.4-201ENST00000621389 339 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 AL353658.2-201ENST00000629794 519 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 GSTT2-203ENST00000634759 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 OASL-202ENST00000339275 1492 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 CCL17-201ENST00000219244 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 AC011284.1-201ENST00000427920 856 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 AC087442.1-201ENST00000525563 249 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 KRTAP10-4-202ENST00000616689 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 SFTPA2-205ENST00000640627 195 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 IL18BP-201ENST00000260049 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 NRG1-211ENST00000520502 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 CELA3A-201ENST00000290122 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 CBR3-AS1-202ENST00000427491 741 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 CBR3-AS1-207ENST00000608641 777 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 OR3A1-202ENST00000615105 966 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POLR2AP24928 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms