Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRIM21P19474 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms