Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR1AO95602 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms