Protein–RNA interactions for Protein: O95045

UPP2, Uridine phosphorylase 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP2O95045 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UPP2O95045 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
UPP2O95045 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UPP2O95045 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
UPP2O95045 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UPP2O95045 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UPP2O95045 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
UPP2O95045 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UPP2O95045 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UPP2O95045 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UPP2O95045 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UPP2O95045 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UPP2O95045 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UPP2O95045 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UPP2O95045 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UPP2O95045 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UPP2O95045 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UPP2O95045 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UPP2O95045 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UPP2O95045 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UPP2O95045 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UPP2O95045 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UPP2O95045 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UPP2O95045 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UPP2O95045 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UPP2O95045 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UPP2O95045 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UPP2O95045 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UPP2O95045 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UPP2O95045 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UPP2O95045 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
UPP2O95045 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UPP2O95045 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UPP2O95045 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UPP2O95045 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UPP2O95045 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UPP2O95045 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
UPP2O95045 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UPP2O95045 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UPP2O95045 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
UPP2O95045 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
UPP2O95045 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UPP2O95045 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UPP2O95045 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UPP2O95045 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UPP2O95045 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UPP2O95045 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
UPP2O95045 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UPP2O95045 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UPP2O95045 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UPP2O95045 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UPP2O95045 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UPP2O95045 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UPP2O95045 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UPP2O95045 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UPP2O95045 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UPP2O95045 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UPP2O95045 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UPP2O95045 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UPP2O95045 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UPP2O95045 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UPP2O95045 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UPP2O95045 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UPP2O95045 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UPP2O95045 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UPP2O95045 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UPP2O95045 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UPP2O95045 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UPP2O95045 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UPP2O95045 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UPP2O95045 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UPP2O95045 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
UPP2O95045 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
UPP2O95045 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UPP2O95045 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UPP2O95045 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UPP2O95045 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UPP2O95045 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
UPP2O95045 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UPP2O95045 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UPP2O95045 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UPP2O95045 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UPP2O95045 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UPP2O95045 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UPP2O95045 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UPP2O95045 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UPP2O95045 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
UPP2O95045 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UPP2O95045 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UPP2O95045 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UPP2O95045 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UPP2O95045 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UPP2O95045 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UPP2O95045 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UPP2O95045 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UPP2O95045 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UPP2O95045 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UPP2O95045 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UPP2O95045 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UPP2O95045 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms