Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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SPAG9O60271 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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SPAG9O60271 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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SPAG9O60271 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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SPAG9O60271 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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SPAG9O60271 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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SPAG9O60271 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
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SPAG9O60271 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
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SPAG9O60271 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPAG9O60271 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPAG9O60271 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
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