Protein–RNA interactions for Protein: O15212

PFDN6, Prefoldin subunit 6, humanhuman

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN6O15212 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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PFDN6O15212 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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PFDN6O15212 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PFDN6O15212 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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