Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOLGA8SH3BPF8 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms