Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC10.92□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC10.92□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC10.92□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.92□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms