Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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