Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TMED7Q9Y3B3 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms