Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 KRTAP4-4-201ENST00000390661 1081 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 AC092068.1-201ENST00000592525 454 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 AC073575.1-201ENST00000551125 596 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPS5Q9UPZ3 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms