Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RRBP1Q9P2E9 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms