Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM2Q9BVW6 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM2Q9BVW6 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM2Q9BVW6 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM2Q9BVW6 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM2Q9BVW6 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM2Q9BVW6 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM2Q9BVW6 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM2Q9BVW6 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM2Q9BVW6 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM2Q9BVW6 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM2Q9BVW6 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM2Q9BVW6 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM2Q9BVW6 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SMIM2Q9BVW6 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM2Q9BVW6 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM2Q9BVW6 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM2Q9BVW6 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM2Q9BVW6 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM2Q9BVW6 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM2Q9BVW6 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM2Q9BVW6 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM2Q9BVW6 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM2Q9BVW6 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM2Q9BVW6 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM2Q9BVW6 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM2Q9BVW6 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM2Q9BVW6 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM2Q9BVW6 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM2Q9BVW6 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM2Q9BVW6 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM2Q9BVW6 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM2Q9BVW6 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM2Q9BVW6 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM2Q9BVW6 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM2Q9BVW6 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM2Q9BVW6 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM2Q9BVW6 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM2Q9BVW6 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM2Q9BVW6 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM2Q9BVW6 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM2Q9BVW6 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM2Q9BVW6 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM2Q9BVW6 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM2Q9BVW6 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM2Q9BVW6 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM2Q9BVW6 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM2Q9BVW6 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM2Q9BVW6 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM2Q9BVW6 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM2Q9BVW6 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM2Q9BVW6 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM2Q9BVW6 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM2Q9BVW6 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM2Q9BVW6 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM2Q9BVW6 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SMIM2Q9BVW6 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 SLX4-201ENST00000294008 7307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 DLGAP1-203ENST00000400147 5258 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
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