Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms