Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 ETFRF1-205ENST00000555711 783 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 CTH-203ENST00000411986 2044 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 RUFY2-201ENST00000265865 2033 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SPOCK3Q9BQ16 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SPOCK3Q9BQ16 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms