Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 ELFN1-AS1-201ENST00000415399 636 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRIQ1Q96JM4 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 NPAS3-209ENST00000551008 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 AL158207.2-201ENST00000414926 266 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 TONSL-AS1-201ENST00000442850 428 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 DMC1-207ENST00000616615 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRIQ1Q96JM4 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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