Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCE1Q969G3 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms