Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP13Q92995 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP13Q92995 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP13Q92995 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP13Q92995 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP13Q92995 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP13Q92995 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP13Q92995 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP13Q92995 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP13Q92995 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
USP13Q92995 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP13Q92995 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP13Q92995 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP13Q92995 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
USP13Q92995 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP13Q92995 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
USP13Q92995 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP13Q92995 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
USP13Q92995 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP13Q92995 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP13Q92995 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP13Q92995 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP13Q92995 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP13Q92995 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP13Q92995 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
USP13Q92995 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
USP13Q92995 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP13Q92995 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP13Q92995 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP13Q92995 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP13Q92995 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP13Q92995 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP13Q92995 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP13Q92995 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP13Q92995 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP13Q92995 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP13Q92995 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP13Q92995 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP13Q92995 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
USP13Q92995 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP13Q92995 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP13Q92995 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP13Q92995 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
USP13Q92995 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP13Q92995 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP13Q92995 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP13Q92995 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP13Q92995 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP13Q92995 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP13Q92995 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP13Q92995 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP13Q92995 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP13Q92995 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP13Q92995 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP13Q92995 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP13Q92995 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
USP13Q92995 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP13Q92995 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
USP13Q92995 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP13Q92995 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP13Q92995 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP13Q92995 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP13Q92995 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP13Q92995 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP13Q92995 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP13Q92995 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP13Q92995 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP13Q92995 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP13Q92995 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP13Q92995 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP13Q92995 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP13Q92995 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP13Q92995 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP13Q92995 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP13Q92995 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP13Q92995 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP13Q92995 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP13Q92995 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP13Q92995 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
USP13Q92995 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP13Q92995 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP13Q92995 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
USP13Q92995 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
USP13Q92995 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP13Q92995 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP13Q92995 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP13Q92995 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP13Q92995 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP13Q92995 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP13Q92995 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP13Q92995 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP13Q92995 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP13Q92995 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP13Q92995 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP13Q92995 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP13Q92995 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP13Q92995 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP13Q92995 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP13Q92995 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
USP13Q92995 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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