Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLIP4Q8N3C7 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLIP4Q8N3C7 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLIP4Q8N3C7 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLIP4Q8N3C7 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLIP4Q8N3C7 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLIP4Q8N3C7 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLIP4Q8N3C7 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLIP4Q8N3C7 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLIP4Q8N3C7 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLIP4Q8N3C7 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLIP4Q8N3C7 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLIP4Q8N3C7 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLIP4Q8N3C7 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLIP4Q8N3C7 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLIP4Q8N3C7 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLIP4Q8N3C7 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLIP4Q8N3C7 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLIP4Q8N3C7 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLIP4Q8N3C7 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLIP4Q8N3C7 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLIP4Q8N3C7 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLIP4Q8N3C7 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLIP4Q8N3C7 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLIP4Q8N3C7 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLIP4Q8N3C7 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLIP4Q8N3C7 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLIP4Q8N3C7 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLIP4Q8N3C7 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLIP4Q8N3C7 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CLIP4Q8N3C7 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLIP4Q8N3C7 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLIP4Q8N3C7 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLIP4Q8N3C7 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CLIP4Q8N3C7 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLIP4Q8N3C7 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLIP4Q8N3C7 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLIP4Q8N3C7 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLIP4Q8N3C7 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLIP4Q8N3C7 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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CLIP4Q8N3C7 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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CLIP4Q8N3C7 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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CLIP4Q8N3C7 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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CLIP4Q8N3C7 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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CLIP4Q8N3C7 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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CLIP4Q8N3C7 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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CLIP4Q8N3C7 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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CLIP4Q8N3C7 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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