Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

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Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMARCD3Q6STE5 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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