Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
WSCD1Q658N2 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
WSCD1Q658N2 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms