Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 LRTM1-201ENST00000273286 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKDCCQ504Y2 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms