Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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