Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
PDCD1Q15116 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PDCD1Q15116 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
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