Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTTNQ14247 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 188.3 ms