Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4AQ13619 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms