Protein–RNA interactions for Protein: Q13522

PPP1R1A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1AQ13522 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PPP1R1AQ13522 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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