Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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ITGB3BPQ13352 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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ITGB3BPQ13352 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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ITGB3BPQ13352 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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ITGB3BPQ13352 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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ITGB3BPQ13352 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGB3BPQ13352 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.2 ms