Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRJQ12913 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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PTPRJQ12913 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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PTPRJQ12913 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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PTPRJQ12913 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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PTPRJQ12913 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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PTPRJQ12913 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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PTPRJQ12913 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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PTPRJQ12913 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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PTPRJQ12913 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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PTPRJQ12913 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRJQ12913 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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