Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TROQ12816 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TROQ12816 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TROQ12816 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TROQ12816 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TROQ12816 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TROQ12816 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TROQ12816 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TROQ12816 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TROQ12816 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TROQ12816 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TROQ12816 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TROQ12816 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TROQ12816 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TROQ12816 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TROQ12816 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TROQ12816 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TROQ12816 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TROQ12816 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TROQ12816 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TROQ12816 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TROQ12816 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TROQ12816 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TROQ12816 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TROQ12816 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TROQ12816 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TROQ12816 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TROQ12816 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TROQ12816 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TROQ12816 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TROQ12816 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TROQ12816 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TROQ12816 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TROQ12816 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TROQ12816 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TROQ12816 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TROQ12816 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TROQ12816 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TROQ12816 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TROQ12816 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TROQ12816 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TROQ12816 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TROQ12816 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TROQ12816 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TROQ12816 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TROQ12816 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TROQ12816 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TROQ12816 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TROQ12816 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TROQ12816 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TROQ12816 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TROQ12816 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TROQ12816 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TROQ12816 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TROQ12816 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TROQ12816 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TROQ12816 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TROQ12816 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TROQ12816 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TROQ12816 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TROQ12816 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TROQ12816 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TROQ12816 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TROQ12816 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TROQ12816 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TROQ12816 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TROQ12816 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TROQ12816 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TROQ12816 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TROQ12816 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TROQ12816 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TROQ12816 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TROQ12816 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TROQ12816 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TROQ12816 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TROQ12816 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TROQ12816 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TROQ12816 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TROQ12816 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TROQ12816 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TROQ12816 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TROQ12816 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TROQ12816 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TROQ12816 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TROQ12816 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TROQ12816 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TROQ12816 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TROQ12816 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TROQ12816 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TROQ12816 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TROQ12816 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TROQ12816 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TROQ12816 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TROQ12816 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TROQ12816 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TROQ12816 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TROQ12816 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TROQ12816 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TROQ12816 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TROQ12816 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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