Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 CELF2-216ENST00000637215 2724 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 CCT3-211ENST00000472765 1858 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 ANGPTL2-201ENST00000373417 2575 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 NAGK-202ENST00000418807 2343 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC173Q0VFZ6 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms