Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 AC091178.1-201ENST00000583447 2305 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 PIK3AP1-201ENST00000339364 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 DNMT1-203ENST00000540357 4916 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 KCNH7-201ENST00000328032 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 TMCO4-202ENST00000375127 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 TRPC7-203ENST00000502753 2424 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 HPSE2-201ENST00000370546 1849 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 AGAP3-226ENST00000622464 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 FAM131B-202ENST00000409346 4295 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 RTN3-203ENST00000341307 2524 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 TMEM200A-201ENST00000296978 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 KRTAP10-4-201ENST00000400374 1643 ntAPPRIS P2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 ATP13A2-203ENST00000452699 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 SLC2A1-203ENST00000426263 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 LINC01209-201ENST00000451289 2400 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 ZNF674-201ENST00000414387 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 GOLGA6L7P-201ENST00000567390 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 CASC15-204ENST00000606197 3969 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 RAB43-203ENST00000393305 4215 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 PXN-204ENST00000424649 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 CDKN2B-201ENST00000276925 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 BBOF1-201ENST00000394009 3106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 KRT17P7-202ENST00000582261 2334 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 TRIM37-203ENST00000393066 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 FAM131B-204ENST00000409578 4286 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 2500 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
CD300CQ08708 TNIP1-201ENST00000315050 2785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 XYLT2-201ENST00000017003 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 ZSCAN5B-202ENST00000586855 2059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 NLRP7-206ENST00000588756 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 BTBD3-203ENST00000399006 4826 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms