Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PPP3CAQ08209 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms