Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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FAM3AP98173 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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FAM3AP98173 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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FAM3AP98173 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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FAM3AP98173 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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FAM3AP98173 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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FAM3AP98173 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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FAM3AP98173 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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FAM3AP98173 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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FAM3AP98173 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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FAM3AP98173 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC12.62□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC12.62□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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