Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CSNK2A1P68400 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms