Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 BARD1-212ENST00000617164 5449 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 ARHGEF11-201ENST00000361409 5788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 BX537318.2-201ENST00000624893 4162 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 IKZF4-201ENST00000262032 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 MESD-201ENST00000261758 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 TMPO-212ENST00000556029 4242 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 TMEM132D-201ENST00000389441 5305 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 PDIK1L-204ENST00000619836 4252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 AC022400.8-201ENST00000623453 3599 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 CDK5RAP2-201ENST00000349780 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 TACC1-201ENST00000276520 6513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 TXNRD1-202ENST00000388854 4277 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 POLR2J4-202ENST00000427076 6466 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 AL022238.4-201ENST00000639722 4563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 SPIN3-201ENST00000374919 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 SPTBN5-201ENST00000320955 11725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 SEC31A-208ENST00000448323 4255 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 PAX6-245ENST00000638914 7300 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 FOSL2-202ENST00000379619 5829 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 SOCS6-201ENST00000397942 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 SLFNL1-202ENST00000359345 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 RGS3-204ENST00000350696 4387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P61574 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms