Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RPS3AP61247 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
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