Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2FP61218 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms