Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF6P49848 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF6P49848 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF6P49848 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF6P49848 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF6P49848 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF6P49848 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF6P49848 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF6P49848 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF6P49848 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF6P49848 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF6P49848 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF6P49848 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF6P49848 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TAF6P49848 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF6P49848 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF6P49848 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF6P49848 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF6P49848 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF6P49848 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF6P49848 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF6P49848 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF6P49848 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF6P49848 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF6P49848 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF6P49848 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF6P49848 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF6P49848 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF6P49848 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF6P49848 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF6P49848 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF6P49848 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF6P49848 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF6P49848 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF6P49848 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF6P49848 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF6P49848 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF6P49848 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF6P49848 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF6P49848 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF6P49848 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF6P49848 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF6P49848 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF6P49848 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF6P49848 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF6P49848 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF6P49848 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF6P49848 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF6P49848 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF6P49848 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF6P49848 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF6P49848 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TAF6P49848 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF6P49848 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF6P49848 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF6P49848 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF6P49848 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF6P49848 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF6P49848 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF6P49848 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF6P49848 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF6P49848 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF6P49848 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF6P49848 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF6P49848 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF6P49848 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF6P49848 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF6P49848 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF6P49848 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF6P49848 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF6P49848 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF6P49848 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF6P49848 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF6P49848 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF6P49848 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF6P49848 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF6P49848 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF6P49848 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF6P49848 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF6P49848 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF6P49848 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF6P49848 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF6P49848 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF6P49848 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF6P49848 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF6P49848 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF6P49848 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF6P49848 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF6P49848 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF6P49848 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF6P49848 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF6P49848 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF6P49848 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF6P49848 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TAF6P49848 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF6P49848 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF6P49848 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF6P49848 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF6P49848 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TAF6P49848 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms