Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 MTCO3P42-201ENST00000509488 518 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 MTCO3P39-201ENST00000514812 518 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 AC012309.1-203ENST00000585860 965 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 DSTNP1-201ENST00000419906 465 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 AP001528.1-201ENST00000499504 1223 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 AP003108.4-201ENST00000623917 878 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 HLA-E-201ENST00000376630 2601 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSEN1P49768 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms