Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCLMP48507 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCLMP48507 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GCLMP48507 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCLMP48507 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCLMP48507 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCLMP48507 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCLMP48507 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCLMP48507 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCLMP48507 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCLMP48507 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GCLMP48507 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GCLMP48507 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCLMP48507 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCLMP48507 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCLMP48507 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCLMP48507 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCLMP48507 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCLMP48507 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCLMP48507 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCLMP48507 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GCLMP48507 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCLMP48507 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCLMP48507 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCLMP48507 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCLMP48507 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCLMP48507 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCLMP48507 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GCLMP48507 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCLMP48507 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCLMP48507 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCLMP48507 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCLMP48507 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCLMP48507 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCLMP48507 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCLMP48507 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCLMP48507 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCLMP48507 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCLMP48507 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCLMP48507 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCLMP48507 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCLMP48507 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCLMP48507 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCLMP48507 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCLMP48507 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCLMP48507 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCLMP48507 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCLMP48507 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCLMP48507 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCLMP48507 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCLMP48507 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCLMP48507 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCLMP48507 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GCLMP48507 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GCLMP48507 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCLMP48507 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCLMP48507 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCLMP48507 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCLMP48507 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCLMP48507 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCLMP48507 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCLMP48507 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCLMP48507 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GCLMP48507 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCLMP48507 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCLMP48507 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCLMP48507 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCLMP48507 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCLMP48507 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCLMP48507 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GCLMP48507 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCLMP48507 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCLMP48507 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCLMP48507 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GCLMP48507 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GCLMP48507 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GCLMP48507 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GCLMP48507 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCLMP48507 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCLMP48507 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCLMP48507 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCLMP48507 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCLMP48507 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCLMP48507 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCLMP48507 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCLMP48507 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCLMP48507 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCLMP48507 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCLMP48507 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCLMP48507 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCLMP48507 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCLMP48507 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCLMP48507 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCLMP48507 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCLMP48507 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCLMP48507 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCLMP48507 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCLMP48507 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GCLMP48507 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GCLMP48507 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms