Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBRP36941 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBRP36941 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBRP36941 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBRP36941 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBRP36941 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBRP36941 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBRP36941 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBRP36941 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBRP36941 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBRP36941 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBRP36941 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBRP36941 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBRP36941 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBRP36941 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBRP36941 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBRP36941 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBRP36941 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBRP36941 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBRP36941 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBRP36941 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBRP36941 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBRP36941 LINC01029-202ENST00000578833 366 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBRP36941 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBRP36941 KRT17P4-203ENST00000579355 621 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBRP36941 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBRP36941 MIR6125-201ENST00000618986 96 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBRP36941 AL513478.2-202ENST00000621949 835 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBRP36941 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBRP36941 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBRP36941 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBRP36941 DAO-208ENST00000551281 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBRP36941 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBRP36941 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBRP36941 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBRP36941 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBRP36941 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LTBRP36941 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBRP36941 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBRP36941 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBRP36941 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBRP36941 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBRP36941 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBRP36941 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBRP36941 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBRP36941 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBRP36941 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBRP36941 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBRP36941 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBRP36941 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBRP36941 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBRP36941 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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LTBRP36941 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBRP36941 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBRP36941 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBRP36941 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBRP36941 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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LTBRP36941 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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LTBRP36941 CELA3A-202ENST00000374663 649 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBRP36941 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBRP36941 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBRP36941 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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LTBRP36941 AP001615.1-201ENST00000423276 461 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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LTBRP36941 CIDEC-205ENST00000443115 443 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBRP36941 IGKV1OR-2-201ENST00000457995 350 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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LTBRP36941 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBRP36941 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBRP36941 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBRP36941 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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LTBRP36941 OAZ3-207ENST00000627780 850 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBRP36941 AC245100.4-201ENST00000634549 1082 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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LTBRP36941 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBRP36941 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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LTBRP36941 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBRP36941 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBRP36941 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBRP36941 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBRP36941 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBRP36941 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBRP36941 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBRP36941 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBRP36941 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBRP36941 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LTBRP36941 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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