Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCR5P32302 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms