Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXA13P31271 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms