Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJB2P29033 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJB2P29033 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GJB2P29033 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJB2P29033 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJB2P29033 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJB2P29033 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GJB2P29033 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJB2P29033 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GJB2P29033 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJB2P29033 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJB2P29033 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJB2P29033 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJB2P29033 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJB2P29033 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GJB2P29033 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJB2P29033 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJB2P29033 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJB2P29033 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJB2P29033 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJB2P29033 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GJB2P29033 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJB2P29033 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJB2P29033 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJB2P29033 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJB2P29033 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJB2P29033 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJB2P29033 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJB2P29033 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJB2P29033 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJB2P29033 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJB2P29033 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJB2P29033 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJB2P29033 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJB2P29033 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GJB2P29033 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJB2P29033 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJB2P29033 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJB2P29033 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJB2P29033 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJB2P29033 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJB2P29033 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJB2P29033 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJB2P29033 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJB2P29033 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJB2P29033 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJB2P29033 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJB2P29033 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJB2P29033 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJB2P29033 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJB2P29033 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJB2P29033 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJB2P29033 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJB2P29033 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJB2P29033 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJB2P29033 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJB2P29033 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJB2P29033 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJB2P29033 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJB2P29033 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJB2P29033 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJB2P29033 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJB2P29033 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GJB2P29033 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJB2P29033 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GJB2P29033 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJB2P29033 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GJB2P29033 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJB2P29033 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJB2P29033 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJB2P29033 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJB2P29033 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJB2P29033 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJB2P29033 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJB2P29033 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJB2P29033 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJB2P29033 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GJB2P29033 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJB2P29033 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJB2P29033 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJB2P29033 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJB2P29033 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJB2P29033 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GJB2P29033 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJB2P29033 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJB2P29033 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJB2P29033 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJB2P29033 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJB2P29033 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJB2P29033 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJB2P29033 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJB2P29033 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJB2P29033 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GJB2P29033 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJB2P29033 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GJB2P29033 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJB2P29033 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GJB2P29033 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJB2P29033 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GJB2P29033 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms