Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SSFA2P28290 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms