Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LMO2P25791 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO2P25791 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO2P25791 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO2P25791 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO2P25791 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO2P25791 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO2P25791 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO2P25791 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO2P25791 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO2P25791 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO2P25791 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO2P25791 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO2P25791 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO2P25791 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO2P25791 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO2P25791 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO2P25791 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO2P25791 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO2P25791 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO2P25791 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO2P25791 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO2P25791 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO2P25791 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO2P25791 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO2P25791 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO2P25791 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO2P25791 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO2P25791 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO2P25791 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO2P25791 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO2P25791 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO2P25791 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO2P25791 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO2P25791 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO2P25791 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO2P25791 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO2P25791 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO2P25791 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO2P25791 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO2P25791 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO2P25791 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO2P25791 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO2P25791 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO2P25791 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO2P25791 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO2P25791 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO2P25791 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO2P25791 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO2P25791 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO2P25791 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO2P25791 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO2P25791 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO2P25791 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LMO2P25791 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LMO2P25791 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LMO2P25791 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LMO2P25791 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LMO2P25791 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LMO2P25791 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LMO2P25791 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LMO2P25791 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LMO2P25791 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LMO2P25791 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LMO2P25791 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LMO2P25791 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LMO2P25791 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LMO2P25791 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LMO2P25791 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LMO2P25791 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LMO2P25791 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LMO2P25791 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LMO2P25791 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LMO2P25791 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LMO2P25791 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LMO2P25791 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LMO2P25791 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LMO2P25791 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LMO2P25791 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LMO2P25791 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LMO2P25791 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LMO2P25791 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LMO2P25791 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LMO2P25791 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LMO2P25791 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LMO2P25791 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LMO2P25791 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LMO2P25791 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LMO2P25791 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LMO2P25791 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LMO2P25791 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LMO2P25791 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LMO2P25791 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LMO2P25791 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LMO2P25791 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LMO2P25791 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LMO2P25791 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LMO2P25791 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LMO2P25791 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LMO2P25791 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms