Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCM3P25205 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCM3P25205 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCM3P25205 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCM3P25205 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCM3P25205 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCM3P25205 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MCM3P25205 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCM3P25205 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCM3P25205 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCM3P25205 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCM3P25205 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCM3P25205 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCM3P25205 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCM3P25205 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCM3P25205 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MCM3P25205 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCM3P25205 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCM3P25205 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MCM3P25205 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCM3P25205 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCM3P25205 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCM3P25205 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCM3P25205 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCM3P25205 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCM3P25205 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCM3P25205 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCM3P25205 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCM3P25205 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCM3P25205 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCM3P25205 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCM3P25205 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCM3P25205 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCM3P25205 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCM3P25205 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCM3P25205 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCM3P25205 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCM3P25205 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCM3P25205 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MCM3P25205 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCM3P25205 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCM3P25205 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCM3P25205 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCM3P25205 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCM3P25205 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCM3P25205 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCM3P25205 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCM3P25205 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCM3P25205 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCM3P25205 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCM3P25205 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCM3P25205 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCM3P25205 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCM3P25205 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCM3P25205 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCM3P25205 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCM3P25205 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCM3P25205 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCM3P25205 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCM3P25205 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCM3P25205 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCM3P25205 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCM3P25205 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCM3P25205 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCM3P25205 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCM3P25205 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCM3P25205 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCM3P25205 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCM3P25205 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCM3P25205 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCM3P25205 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCM3P25205 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCM3P25205 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCM3P25205 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCM3P25205 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCM3P25205 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCM3P25205 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCM3P25205 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCM3P25205 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCM3P25205 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCM3P25205 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCM3P25205 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MCM3P25205 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCM3P25205 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCM3P25205 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCM3P25205 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCM3P25205 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCM3P25205 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MCM3P25205 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCM3P25205 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCM3P25205 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCM3P25205 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCM3P25205 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCM3P25205 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCM3P25205 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCM3P25205 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCM3P25205 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCM3P25205 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCM3P25205 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCM3P25205 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms