Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 CLUAP1-201ENST00000341633 1643 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 CCL17-201ENST00000219244 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 PDE4DIP-202ENST00000369347 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 AC006328.1-201ENST00000437571 379 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 RN7SL173P-201ENST00000461853 292 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 AC004893.2-203ENST00000482799 796 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 AP003040.1-201ENST00000532044 1024 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 AAMDC-210ENST00000532481 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 WNT5B-206ENST00000542408 508 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 GRAMD4P6-201ENST00000556999 244 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 MIR339-201ENST00000362153 94 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 KCNK15-AS1-202ENST00000427303 528 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 SLC13A2-205ENST00000545060 1276 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 AL513478.2-202ENST00000621949 835 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 CCDC32-215ENST00000625629 801 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PTPRBP23467 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PTPRBP23467 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PTPRBP23467 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PTPRBP23467 BPIFB6-201ENST00000349552 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
PTPRBP23467 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
PTPRBP23467 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PTPRBP23467 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PTPRBP23467 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PTPRBP23467 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PTPRBP23467 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PTPRBP23467 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PTPRBP23467 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PTPRBP23467 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PTPRBP23467 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PTPRBP23467 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PTPRBP23467 AL356000.1-201ENST00000441073 1238 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
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PTPRBP23467 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PTPRBP23467 AL031710.1-201ENST00000570022 468 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PTPRBP23467 AL512324.3-201ENST00000619383 882 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PTPRBP23467 AC009041.4-201ENST00000620075 638 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PTPRBP23467 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PTPRBP23467 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PTPRBP23467 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PTPRBP23467 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PTPRBP23467 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PTPRBP23467 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PTPRBP23467 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PTPRBP23467 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PTPRBP23467 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PTPRBP23467 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PTPRBP23467 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PTPRBP23467 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PTPRBP23467 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PTPRBP23467 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PTPRBP23467 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PTPRBP23467 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PTPRBP23467 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PTPRBP23467 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PTPRBP23467 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PTPRBP23467 IL1F10-201ENST00000341010 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PTPRBP23467 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PTPRBP23467 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PTPRBP23467 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PTPRBP23467 MIR5091-201ENST00000578707 93 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PTPRBP23467 KRTAP10-4-202ENST00000616689 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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