Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HRCP23327 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HRCP23327 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HRCP23327 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HRCP23327 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HRCP23327 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HRCP23327 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HRCP23327 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HRCP23327 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HRCP23327 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HRCP23327 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HRCP23327 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HRCP23327 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HRCP23327 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HRCP23327 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HRCP23327 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HRCP23327 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HRCP23327 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HRCP23327 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HRCP23327 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HRCP23327 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HRCP23327 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HRCP23327 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HRCP23327 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HRCP23327 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HRCP23327 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HRCP23327 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HRCP23327 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HRCP23327 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HRCP23327 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HRCP23327 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HRCP23327 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HRCP23327 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HRCP23327 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HRCP23327 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HRCP23327 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HRCP23327 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HRCP23327 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HRCP23327 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HRCP23327 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HRCP23327 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HRCP23327 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HRCP23327 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HRCP23327 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HRCP23327 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HRCP23327 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HRCP23327 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HRCP23327 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HRCP23327 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HRCP23327 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HRCP23327 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HRCP23327 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HRCP23327 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HRCP23327 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HRCP23327 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HRCP23327 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HRCP23327 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HRCP23327 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HRCP23327 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HRCP23327 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HRCP23327 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HRCP23327 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HRCP23327 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HRCP23327 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HRCP23327 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HRCP23327 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HRCP23327 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HRCP23327 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HRCP23327 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HRCP23327 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HRCP23327 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HRCP23327 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HRCP23327 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HRCP23327 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HRCP23327 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HRCP23327 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HRCP23327 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HRCP23327 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HRCP23327 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HRCP23327 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HRCP23327 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HRCP23327 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HRCP23327 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HRCP23327 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HRCP23327 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HRCP23327 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HRCP23327 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HRCP23327 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HRCP23327 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HRCP23327 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HRCP23327 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HRCP23327 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HRCP23327 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HRCP23327 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HRCP23327 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HRCP23327 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HRCP23327 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HRCP23327 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HRCP23327 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HRCP23327 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms